El Gobierno Nacional, mediante el Ministerio de Desarrollo Económico y Productivo y la Subsecretaría de Acuacultura, implementa acciones de preparación para reducir los posibles impactos que podría generar el Evento El Niño en la actividad acuícola del país. La estrategia busca proteger la producción, infraestructura y continuidad de las unidades productivas frente a eventuales inundaciones y lluvias intensas.
Como parte de esta planificación, las autoridades identifican las zonas con mayor susceptibilidad a inundaciones y brindan asistencia técnica a los productores. En Ecuador existen aproximadamente 7.476 predios destinados a actividades acuícolas, entre cultivos de camarón y especies piscícolas criadas en cautiverio.

Según información del Informe Ejecutivo ENOS 2026, elaborada con datos del sistema SIGACUA y mapas de susceptibilidad de la Secretaría Nacional de Gestión de Riesgos, se contabilizan 3.431 predios camaroneros. De ellos, 2.977, equivalentes al 86,8 %, están ubicados en sectores con algún nivel de susceptibilidad a inundaciones. Los casos de mayor vulnerabilidad se concentran principalmente en Guayas, El Oro, Manabí y Esmeraldas.
En la piscicultura se registran 4.045 predios a escala nacional, de los cuales 433, correspondientes al 10,7 %, se encuentran en zonas con algún grado de susceptibilidad. Ante este escenario, la Subsecretaría de Acuacultura desarrolla acciones en tres etapas: prevención, respuesta ante posibles afectaciones y reactivación de las actividades productivas.
Entre las recomendaciones se incluye revisar y reforzar diques, taludes, muros, canales y sistemas hidráulicos, además de comprobar el funcionamiento de bombas, compuertas, generadores y equipos de aireación. También se plantea mantener los niveles de agua entre 10 % y 20 % por debajo de la capacidad máxima durante períodos lluviosos y contar con materiales, combustible y protocolos de respuesta. En caso de daños, las autoridades prevén brindar asistencia técnica y, durante la etapa de recuperación, entregar alevines de trucha, tilapia y cachama a productores vulnerables o afectados.